Search Result of "phylogenetic tree"

About 60 results
Img
Img
Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

Distribution of Micromonospora Isolated from Sugar Cane in Thailand

ผู้แต่ง:ImgDr.KANOKKORN SINMA, Lecturer, ImgK. khacharoenphaisan,

วารสาร:

Img

Img
Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

MULTILOCUS SEQUENCE TYPING OF BRUCELLA ISOLATES FROM THAILAND

ผู้แต่ง:ImgWireeya Chawjiraphan, ImgPiengchan Sonthayanon, ImgPhanita Chanket, ImgSurachet Benjathummarak, ImgDr.ANUSAK KERDSIN, Assistant Professor, ImgThareerat Kalambhaheti,

วารสาร:

Img
Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

Phylogenetic analyses of DENV-3 isolated from field-caught mosquitoes in Thailand

ผู้แต่ง:ImgSittivicharpinyo, T., ImgDr.Passorn Wonnapinij, Assistant Professor, ImgDr.WUNRADA SURAT, Assistant Professor,

วารสาร:

Img Img

Img
Img
Img
Img
Img
Img
Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : Molecular Identification of Cycas by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) and Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD))

ผู้เขียน:Imgพัทธมน แสงอินทร์, Imgนางอมรา ทองปาน, รองศาสตราจารย์, ImgAnders J. Lindstrom, Imgดร.มิ่งขวัญ มิ่งเมือง, รองศาสตราจารย์

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

RAPD and RFLP were used to identify nineteen species of Cycas. Ten species of these Cycas namely C. chamaoensis, C. macrocarpa, C. pectinata, C. clivicola, C. pranburiensis, C. litoralis, C. tansachana, C. siamensis, C. nongnoochiae and C. simplicipinna are locally found in Thailand while the nine remaining species of C. seemannii, C. wadei, C. bougainvilleana, C. chevalieri, C. diannanensis, C. nathorstii, C. edentata, C. parvulus and C. micholitzii are from several countries around the world but collectively planted at Nong Nooch Tropical Botanical Garden. In the RAPD study, twenty random primers were screened to amplify the genomic DNA of nineteen species of Cycas. Only five primers, i.e., OPB-1, OPB-8, OPB-14, OPB-15 and OPB-17 of ten nucleotides long were found to give polymorphic DNA patterns. These eighty-seven bands of Cycas DNA at the size of 0.35 -2.5 kb could be used to indicate the differences of these Cycas. As for RFLP, three probes were synthesized from 5S rRNA gene, 5S rRNA repeat unit gene of C. clivicola and 18S rRNA gene of C. pranburiensis. The probes were hybridized with the genomic DNA of Cycas which had been digested with restriction enzymes BamHI, EcoRI and DraI. The phylogenetic trees were constructed based on their similarity index derived from DNA polymorphism of RAPD and RFLP separately. The RAPD data classified nineteen species of Cycas into two major groups which mostly corresponded to their geographic origins, i.e., one group of Thailand origin and another of other countries. However, the RFLP data gave a different set of grouping showing more to their morphological characteristics but less on their geographic origins.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 040, Issue 1, Jan 06 - Mar 06, Page 107 - 120 |  PDF |  Page 

Img
Img
Img
Img

ที่มา:การประชุมวิชาการพฤกษศาสตร์แห่งประเทศไทยครั้งที่ 4

หัวเรื่อง:ตำแหน่งจัดวางของแคสันติสุข (Santisukia Brummitt) พืชถิ่นเดียวของไทย ในแผนภูมิวงศ์วานวิวัฒนาการของวงศ์แค

Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : An Analysis of the Phylogenetic Relationship of Thai Cervids Inferred from Nucleotide Sequences of Protein Kinase C Iota (PRKCI) Intron)

ผู้เขียน:Imgกณิตา อุ่ยถาวร, Imgดร.นริศ ภูมิภาคพันธ์, รองศาสตราจารย์, ImgJessada Denduangboripant, ImgBoripat Siriaroonrat, Imgดร.สาวิตร ตระกูลน่าเลื่อมใส, ผู้ช่วยศาสตราจารย์

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

The phylogenetic relationship of five Thai cervid species (n=21) and four spotted deer (Axis axis, n=4), was determined based on nucleotide sequences of the intron region of the protein kinase C iota (PRKCI) gene. Blood samples were collected from seven captive breeding centers in Thailand from which whole genomic DNA was extracted. Intron1 sequences of the PRKCI nuclear gene were amplified by a polymerase chain reaction, using L748 and U26 primers. Approximately 552 base pairs of all amplified fragments were analyzed using the neighbor-joining distance matrix method, and 19 parsimonyinformative sites were analyzed using the maximum parsimony approach. Phylogenetic analyses using the subfamily Muntiacinae as outgroups for tree rooting indicated similar topologies for both phylogenetic trees, clearly showing a separation of three distinct genera of Thai cervids: Muntiacus, Cervus, and Axis. The study also found that a phylogenetic relationship within the genus Axis would be monophyletic if both spotted deer and hog deer were included. Hog deer have been conventionally classified in the genus Cervus (Cervus porcinus), but this finding supports a recommendation to reclassify hog deer in the genus Axis.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 043, Issue 4, Oct 09 - Dec 09, Page 709 - 719 |  PDF |  Page 

Img

ที่มา:ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพห่งชาติ สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

หัวเรื่อง:การศึกษาความหลากหลายทางชีวภาพของเชื้อไวรัสสาเหตุโรคแตงกวา

หัวหน้าโครงการ:Imgดร.พิสสวรรณ เจียมสมบัติ, ผู้ช่วยศาสตราจารย์

123