Search Result of "cDNA-SRAP"

About 8 results
Img
Img
Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : Detection of Photoperiod Responsive Gene in KDML 105 Rice (Oryza sativa L.) using cDNA-SRAP Technique)

ผู้เขียน:Imgชูชัย เนตรธุวกุล, Imgนายประดิษฐ์ พงศ์ทองคำ, ศาสตราจารย์, Imgนางอมรา ทองปาน, รองศาสตราจารย์, Imgสุรินทร์ ปิยะโชคณากุล

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

Sequence-related amplified polymorphism (SRAP) was used for detecting photoperiod responsive gene of KDML 105 rice (Oryza sativa L.). Ten out of 16 primer combinations gave 42 different bands from the cDNA of KDML 105 rice after exposure to short day (SD) photoperiod. The DNA bands larger than 200 bp were collectively selected for cloning and sequencing. Fourteen from 16 cDNA-SRAP markers showed 87–100% similarity to sequences in the GenBank database, but most nucleotide sequences were unknown genes. Gene expression was further elucidated by RT-PCR. The results, however, were rather contradicted to the obtained cDNA-SRAP pattern. Considering DNA band intensity, there were two candidate genes having higher level of expression in SD treatment. Relative qRT-PCR was used for checking the level of gene expression. The result showed that the expression level of candidate gene from KM2-3 marker increased up to 4.63 folds at 6 days after treatment with SD photoperiod. This indicated its high possibility of being a photoperiod responsive gene which most likely corresponds to another class of gene regulating the flowering time in rice. Cloning of this gene was performed by RT-PCR with a primer pair covering the whole open reading frame (ORF). The 546 bp DNA fragment was cloned, sequenced and analyzed. This fragment had one ORF and deduced a polypeptide of 134 amino acid residues. The nucleotide sequence of this gene was submitted to the GenBank database as gi|83972339.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 041, Issue 4, Oct 07 - Dec 07, Page 651 - 659 |  PDF |  Page 

Img

ที่มา:วิทยานิพนธ์ ปริญญาโท (จาก: บัณฑิตวิทยาลัย และ สำนักหอสมุด มก.)

หัวเรื่อง:การตรวจหายีนที่ตอบสนองต่อช่วงแสงในข้าว (Oryza sativa L.) พันธุ์ขาวดอกมะลิ 105 โดยใช้เทคนิค cDNA-SRAP

ผู้เขียน:Imgชูชัย เนตรธุวกุล

ประธานกรรมการ:Imgสุรินทร์ ปิยะโชคณากุล

กรรมการวิชาเอก:Imgนายประดิษฐ์ พงศ์ทองคำ, ศาสตราจารย์

กรรมการวิชารอง:Imgดร.ปุณฑริกา หะริณสุต, รองศาสตราจารย์

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract


Dissertation/Thesis Info
Abstract  (cache) |  Full text  (cache)  | Page  (Info)

Img
Img

Researcher

นาย ประดิษฐ์ พงศ์ทองคำ, ศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพันธุศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:เพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อพืช (Plant Tissue Culture), ปรับปรุงพันธุ์พืช (Plant Breeding)

Resume

Img

Researcher

นาง อมรา ทองปาน, รองศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพันธุศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:Cell of Molecular Biology

Resume

Img

Researcher

ดร. สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล, รองศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพันธุศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:Molecular Genetics , Plant Gene Transformation, Plant Genome Analysis by Molecular Markers

Resume