Search Result of "RFLP"

About 141 results
Img
Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

Catfish species identification using lab-on-chip PCR-RFLP

ผู้แต่ง:ImgWong, L.L., ImgPeatman, E., ImgKelly, L., ImgKucuktas, H., ImgDr.Uthairat Na-Nakorn, Professor, ImgLiu, Z.,

วารสาร:

Img Img

Img
Img

การประชุมวิชาการ

RFLP Identification of Colletotrichum species isolated from chilli in Thailand

ผู้แต่ง:

การประชุมวิชาการ:

Img
Img
Img

การประชุมวิชาการ

Differentiation of lactic acid bacteria of Mum (Thai fermented sausage) based on restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis (2012)

ผู้แต่ง:

การประชุมวิชาการ:

Img
Img
Img
Img
Img
Img
Img
Img

ที่มา:วิทยานิพนธ์ ปริญญาโท (จาก: บัณฑิตวิทยาลัย และ สำนักหอสมุด มก.)

หัวเรื่อง:Differentiation of Varanus spp. in Thailand by Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP)

ผู้เขียน:Imgวัลยา ผ่องแผ้ว

ประธานกรรมการ:Imgดร.ธีระพล ศิรินฤมิตร, รองศาสตราจารย์

กรรมการร่วม:Imgดร.เฉลียว ศาลากิจ, ศาสตราจารย์

สื่อสิ่งพิมพ์:Library Collection

Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : Molecular Identification of Cycas by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) and Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD))

ผู้เขียน:Imgพัทธมน แสงอินทร์, Imgนางอมรา ทองปาน, รองศาสตราจารย์, ImgAnders J. Lindstrom, Imgดร.มิ่งขวัญ มิ่งเมือง, รองศาสตราจารย์

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

RAPD and RFLP were used to identify nineteen species of Cycas. Ten species of these Cycas namely C. chamaoensis, C. macrocarpa, C. pectinata, C. clivicola, C. pranburiensis, C. litoralis, C. tansachana, C. siamensis, C. nongnoochiae and C. simplicipinna are locally found in Thailand while the nine remaining species of C. seemannii, C. wadei, C. bougainvilleana, C. chevalieri, C. diannanensis, C. nathorstii, C. edentata, C. parvulus and C. micholitzii are from several countries around the world but collectively planted at Nong Nooch Tropical Botanical Garden. In the RAPD study, twenty random primers were screened to amplify the genomic DNA of nineteen species of Cycas. Only five primers, i.e., OPB-1, OPB-8, OPB-14, OPB-15 and OPB-17 of ten nucleotides long were found to give polymorphic DNA patterns. These eighty-seven bands of Cycas DNA at the size of 0.35 -2.5 kb could be used to indicate the differences of these Cycas. As for RFLP, three probes were synthesized from 5S rRNA gene, 5S rRNA repeat unit gene of C. clivicola and 18S rRNA gene of C. pranburiensis. The probes were hybridized with the genomic DNA of Cycas which had been digested with restriction enzymes BamHI, EcoRI and DraI. The phylogenetic trees were constructed based on their similarity index derived from DNA polymorphism of RAPD and RFLP separately. The RAPD data classified nineteen species of Cycas into two major groups which mostly corresponded to their geographic origins, i.e., one group of Thailand origin and another of other countries. However, the RFLP data gave a different set of grouping showing more to their morphological characteristics but less on their geographic origins.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 040, Issue 1, Jan 06 - Mar 06, Page 107 - 120 |  PDF |  Page 

Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : In silico PCR-RFLP of Bacillus Species: Problem-Based Case of Teaching Bioinformatics)

ผู้เขียน:ImgEkachai Chukeatirote, ImgKomsit Wisitrasamewong, ImgJedsadapa Jongmahasavat

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

Bioinformatics is a multi-disciplinary subject that encompasses a wide range of fields including; genomics, biotechnology, information technology, algorithms and statistics. As a result, it is important to establish a skeletal set of courses capable of providing both a general and a detailed background on all aspects of bioinformatics. In this study, a problem-based project entitled “in silico PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism) of Bacillus species” was assigned to students. The project aimed to cover the background of genetic information retrieval, multiple sequence alignment, phylogenetic analysis and in silico PCR-RFLP. Initially, the 16S rRNA genes of 34 Bacillus species were retrieved from the NCBI database. The sequence data obtained were then analyzed in terms of their similarities and variation using the ClustalW software. Subsequently, the phylogenetic tree was constructed to investigate their evolutionary relationship. The results indicated that these Bacillus species could be grouped into different clades. In addition, in silico PCR-RFLP was performed to introduce students to the principles of molecular taxonomy.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 042, Issue 4, Oct 08 - Dec 08, Page 693 - 700 |  PDF |  Page 

Img

ที่มา:วิทยาศาสตร์เกษตร

หัวเรื่อง:การวิเคราะห์สายพันธุ์เห็ดฟางด้วยวิธี ITS-PCR-RFLP

Img

ที่มา:การประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาตร์ ครั้งที่ 48

หัวเรื่อง:การแยกชนิสัตว์ในสกุล Varanus spp. ที่พบในประเทศไทยดยเทคนิค Polymerase Chain reaction-Restriction Fragment Length Polymorphophism (PCR-RFLP)

Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : Species Identification of 3 Hypsibarbus spp. (Pisces: Cyprinidae) Using PCR–RFLP of Cytochrome b Gene)

ผู้เขียน:Imgดร.พัฒนี จันทรโรทัย, รองศาสตราจารย์, Imgสุรภพ สุทธิวิเศษ, ImgWongpathom Kamonrat, Imgสุรินทร์ ปิยะโชคณากุล, ImgChavalit Vidthayanon

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

Polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR–RFLP) was used to identify 3 closely related Hypsibarbus spp: Hypsibarbus wetmorei, H. vernayi, and H. malcolmi. Mitochondrial cytochrome b gene (993 bp) in 3 Hypsibarbus spp. showed single PCR– product. The sequencing results of PCR–products in 3 Hypsibarbus spp. showed very low interspecific variation. However it could be used to discriminate these species by RFLP analysis. The combination of 2 restriction enzymes; Bsp143I and BcuI were used to identify 3 Hypsibarbus spp. Bsp143I could discriminate H. vernayi from H. wetmorei and H. malcolmi, by generating 3 fragments (535 bp, 234 bp and 224 bp) in H. vernayi whereas 2 fragments of 769 bp and 224 bp in H. wetmorei and H. malcolmi. Thereafter, BcuI was effectively discriminated H. wetmorei from H. malcolmi by generating 3 fragments (591 bp, 288 bp and 114 bp) in H. malcolmi and uncut fragment in H. wetmorei. There were intraspecific restriction polymorphism in H. vernayi using BcuI which generated 2 patterns; an uncut fragment and 2 fragment of approximately 700 bp and 300 bp. Thus, PCR–RFLP technique could be used to identify 3 closely related Hypsibarbus spp.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 041, Issue 4, Oct 07 - Dec 07, Page 660 - 666 |  PDF |  Page 

12345678