Search Result of "transposable element"

About 9 results
Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

Treatment of 5-azacytidine as DNA demethylating agent in Jatropha curcas L.

ผู้แต่ง:Imgธิติ กาญจนเกตุ, ImgDr.Vipa Hongtrakul, Associate Professor,

วารสาร:

Img

Img
Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : Treatment of 5-Azacytidine as DNA Demethylating Agent in Jatropha curcas L.)

ผู้เขียน:Imgฐิติ กาญจนเกตุ, Imgดร.วิภา หงษ์ตระกูล, รองศาสตราจารย์

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

The role of DNA methylation (the most well-known epigenetic regulation mechanism found in many plant species) was investigated in the development of Jatropha curcas L. using the DNA demethylating agent, 5-azacytidine (AzaC). The treatments were performed in the greenhouse and as a separate embryo culture experiment. The results showed that plants responded to AzaC by both accelerating and inhibiting growth and development. Some plants exhibited observable morphological abnormalities, such as stem bending, reduced plant height and increased stem branching. The most severe effect in the treated plants was the significant failure of root development, which was lethal. The efficiency of AzaC was confirmed by methylation sensitive amplification polymorphism (MSAP) analysis of the treated plants. The MSAP fingerprints showed changes in DNA methylation at the nucleotide level. The cDNA-amplified fragment length polymorphism (cDNA-AFLP) analysis revealed differential gene expression in the treated plants compared to the untreated control plants in both the greenhouse and embryo culture experiments. The differential sequences matched with some known genes. However, the majority of differential sequences were found to be retroelement derivatives. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis of four major DNA methyltransferase genes indicated that only the DRM and Dnmt2 genes were up-regulated in AzaC-treated J. curcas plants. This study demonstrated the important role of DNA methylation in the normal development of J. curcas. The cDNA-AFLP and RT-PCR results led to the hypothesis that AzaC inhibits DNA methylation in particular regions during the first stage of plant development and is involved in the movement of the transposable element in the genome which in turn causes phenotypic abnormalities and activates RNA-dependent DNA methylation pathways. However, this hypothesis requires further intensive study.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 049, Issue 4, Jul 15 - Aug 15, Page 524 - 535 |  PDF |  Page 

Img

Researcher

ดร. ณรงค์ฤทธิ์ เมืองใหม่, ผู้ช่วยศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาชีววิทยาประมง คณะประมง บางเขน

สาขาที่สนใจ:Aquatic biodiversity, Phylogeography , Molecular phylogenetics and evolution, Phycology, Cryptic Diversity, Speciation, Population Genetic, Marine Genomics

Resume

Img

Researcher

ดร. เอกพันธ์ ไกรจักร์, ผู้ช่วยศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพฤกษศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:Bryophytes , Lichens, Ecology, Evolution, Applied phylogenetics

Resume

Img

Researcher

ดร. ครศร ศรีกุลนาถ, รองศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพันธุศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

Resume

Img

Researcher

ดร. สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล, รองศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพันธุศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:Molecular Genetics , Plant Gene Transformation, Plant Genome Analysis by Molecular Markers

Resume

Img

Researcher

ดร. วิภา หงษ์ตระกูล, รองศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพันธุศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:Molecular Genetics

Resume

Img

Researcher

ดร. อุทัยรัตน์ ณ นคร, ศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ คณะประมง บางเขน

สาขาที่สนใจ: พันธุศาสตร์สัตว์น้ำ , การเพาะพันธุ์สัตว์น้ำ

Resume