Search Result of "Chloroplast DNA"

About 34 results
Img
Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

Chloroplast DNA variation of Dalbergia cochinchinensis Pierre inThailand and Laos

ผู้แต่ง:ImgDr.Sutee Duangjai, Assistant Professor, ImgRatree Yooyuen, ImgSuchitra Changtragoon,

วารสาร:

Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

Sequence Analysis of the 16SrRNA-rps12 Inverted Repeat Region in Chloroplast DNA of a Dendrobium Orchid

ผู้แต่ง:

วารสาร:

Img

Img

ผลงานตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ

A phylogeny for two cycad families (Stangeriaceae and Zamiaceae) based on chloroplast DNA sequences

ผู้แต่ง:ImgPattamon Sangin, ImgPaul I Forster, ImgDr.Mingkwan Mingmuang, Associate Professor, ImgGoro Kokubugata,

วารสาร:

Img
Img
Img
Img
Img

การประชุมวิชาการ

Chloroplast DNA Phylogeography of Dalbergia Cochinchinensis Pierre in Thailand and Laos (2011)

ผู้แต่ง:ImgRatree Yooyuen, ImgDr.Sutee Duangjai, Assistant Professor, ImgSuchitra Changtragoon,

การประชุมวิชาการ:

Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : Sequence Analysis of the 16SrRNA-rps12 Inverted Repeat Region in Chloroplast DNA of a Dendrobium Orchid)

ผู้เขียน:ImgBenjawan Lertwiriyawong, Imgกฤษณา พินิจ, Imgพัฒนา ศรีฟ้า ฮุนเนอร์

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

The 16S ribosomal RNA (16SrRNA)-ribosomal protein S12 (rps12) DNA located in the inverted repeat regions (IRs) of chloroplast DNA (cpDNA) can be used as an efficient targeting region for plastid vector construction in plastid transformation systems. Thus, the 16S rRNA-rps12 cpDNA sequence of Dendrobium Jacquelyn Thomas ‘UH44-50’ was cloned and analyzed. The 3,782 base pair (bp) 16SrRNArps12 DNA sequence isolated from this Dendrobium cultivar was 97% similar to the related Phalaenopsis aphrodites (AY916449) and Oncidium Gower Ramsey (GQ324949) cpDNA. It was composed of the highly conserved sequence of 1,427 bp 16SrRNA at the 5?-end, 99 bp of rps12 at the 3?-end and 72 bp of the transfer RNA Valine (GAC) (trnV (GAC)). Nevertheless, the most variable regions were located in a 1,955 bp long spacer between the 3?-end trnV (GAC) and the 5?-end rps12. Apart from Phalaenopsis and Oncidium cpDNAs, the 16SrRNA-rps12 alignment of the Dendrobium nucleotide with nine other published sequences showed that this cpDNA region was unpredictably more homologous to Phoenix dactylifera, Liriodendron tulipifera and Drimys granadensis cpDNAs than those of grasses, including Oryza japonica, Triticum aestivum and Zea mays. The conserved and variable regions in the 16SrRNArps12 fragments of all twelve different species were located exactly in the same positions and orientation. Therefore, the highly conserved flanking regions of 16S rRNA-rps12 Dendrobium cpDNA have potential to be an appropriate homologous sequence for plastid transformation in orchids.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 045, Issue 3, May 11 - Jun 11, Page 461 - 472 |  PDF |  Page 

Img

ที่มา:วิทยาสารเกษตรศาสตร์ สาขา วิทยาศาสตร์

หัวเรื่อง:ไม่มีชื่อไทย (ชื่ออังกฤษ : Phylogenetic Relationships Within Cycadaceae Inferred from Non-Coding Regions of Chloroplast DNA)

ผู้เขียน:Imgพัทธมน แสงอินทร์, ImgAnders J. Lindstrom, ImgGoro Kokubugata, Imgนางสาวมินตา ชัยประสงค์สุข, อาจารย์, Imgดร.มิ่งขวัญ มิ่งเมือง, รองศาสตราจารย์

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract

The intrageneric relationships among 24 species of five Cycas sections based on the combined data of three non-coding regions of chloroplast DNA: trnS-trnG, psbM-trnD and trnL-trnF, were determined using Neighbor-joining, Maximum parsimony and Maximum likelihood methods. All three methods showed similar topology, which divided Cycas into several clades. The first clade consisted of two sections, Cycas and Indosinenses, while the other clades contained Asiorientales, Wadeanae and Stangerioides, which could not be resolved. This result indicated the polyphyletic group of Cycas sections. Base substitution patterns further revealed that the subsection Rumphiae of the section Cycas could be separated into two groups (C. rumphii and C. edentata). In addition, the high bootstrap demonstrated that C. taitungensis was closely related to C. revotuta, while two other species of the section Wadeanae (C. wadei and C. curranii) were closely related, which agreed with the morphology. Data analyses suggested that the trnS-trnG sequences were more informative than the psbM-trnD and trnL-trnF regions in addressing phylogeny. Short and moderate repeated sequences detected in this region also indicated the high rate of evolution in the Cycas species. The 14 bp tandem repeats identified in this study are the first to be reported on the non-coding chloroplast DNA of Cycas.

Article Info
Agriculture and Natural Resources -- formerly Kasetsart Journal (Natural Science), Volume 044, Issue 4, Jul 10 - Aug 10, Page 544 - 557 |  PDF |  Page 

Img

ที่มา:Multinational and Transboundary Conservation of Valuable and Endangered Forest Tree Species

หัวเรื่อง:Chloroplast DNA Phylogeography of Dalbergia Cochinchinensis Pierre in Thailand and Laos

Img
Img
Img

Researcher

ดร. สุธีร์ ดวงใจ, ผู้ช่วยศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาชีววิทยาป่าไม้ คณะวนศาสตร์ บางเขน

Resume

Img

ที่มา:วิทยานิพนธ์ ปริญญาโท (จาก: บัณฑิตวิทยาลัย และ สำนักหอสมุด มก.)

หัวเรื่อง:ความสัมพันธ์ของปรงในสกุล Cycas โดยใช้ดีเอ็นเอในคลอโรพลาสต์ เปรียบเทียบกับลักษณะทางสัณฐานวิทยาและการกระจายพันธุ์

ผู้เขียน:Imgณัฐฐาพิชามณชุ์ อุดมโภชน์

ประธานกรรมการ:Imgดร.มิ่งขวัญ มิ่งเมือง, รองศาสตราจารย์

กรรมการวิชาเอก:ImgKunsiri Chaw Grubbs, Imgนางอมรา ทองปาน, รองศาสตราจารย์

กรรมการวิชารอง:Imgมาลี ณ นคร

สื่อสิ่งพิมพ์:pdf

Abstract


Dissertation/Thesis Info
Abstract  (cache) |  Full text  (cache)  | Page  (Info)

Img
Img

Researcher

ดร. มิ่งขวัญ มิ่งเมือง, รองศาสตราจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาวิทยาศาสตร์พื้นพิภพ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:Cell and Molecolar Biology, Plant Molecular Biology

Resume

Img
Img

Researcher

นางสาว มินตา ชัยประสงค์สุข, อาจารย์

ที่ทำงาน:ภาควิชาพฤกษศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ บางเขน

สาขาที่สนใจ:plant secondary metabolism, plant functional genomics

Resume

12