Person Image

    Education

    • วท.บ.(ฟิสิกส์), มหาวิทยาลัยมหิดล, ไทย, 2546
    • ปร.ด.((ฟิสิกส์), มหาวิทยาลัยมหิดล, ไทย, 2550

    Expertise Cloud

    3-methylcrotonyl-CoA carboxylaseAspergillus oryzaeAtomistic molecular dynamics simulationsball millingBarrier effectsBETABeta CyclodextrinBilaminate membranesBi-layerBroilerBulk densityCancerCarbon NanoparticleCarbon nanoparticlescarbon nanotubeCHOLESTEROLClassificationClathrate cagesCoarse-Grained ModelCoarse-grained modelingcoarse-grained molecular dynamic simulationscoarse-grained molecular dynamics simulationCoarse-grained molecular dynamics simulationscoldCold denaturationCombined analysisComparatives studiesCyclodextrinCyclodextrin derivativesCytologydenaturationDensity (specific gravity)Dipalmitoyl phosphatidylcholineDipalmitoylphosphatidylcholineDNA sequencingDouble bondsDrug DeliveryDunlopDynamic networkDynamics simulationdynamics simulationselasticityEnergy absorptionEnvironment ManagementEnzymesExposed toFeed intakeFinite size effectFlip flop circuitsflip-flopFoam morphologyFoamed rubberForkhead box M1Free energyFree radicalsFree-energy calculationsFreezing techniquesFullerenehomology modelingImage ProcessingLipid bilayerLipid bilayersmembrane damageMolecular dynamicsMolecular dynamics simulationMolecular Dynamics SimulationsmorphologyNatural Rubberoxidized lipidPermeationphosphatidylcholinephospholipidPhospholipidsthermodynamicsการจำลองพลวัติเชิงโมเลกุลการนำส่งยาไก่เนื้อดัชนีที่นอนยางพาราฟลาโวนอยด์ฟาร์มไก่ฟาร์มไก่อัจฉริยะฟิล์มบางผลึกเหลวโฟมยางโภชนศาสตร์สัตว์มอนติคาร์โลมะเร็งเต้านมมาสเตอร์แบทช์ เมมเบรนชีวภาพสิ่งแวดล้อมสูตรน้ำยางขั้นสูงหมอนหมอนยางพาราห้องปฏิบัติการมาตรฐานอนุภาคนาโนอนุภาคนาโนคาร์บอนอวกาศอานุภาคนาโนอินเทอร์เน็ตทุกสรรพสิ่ง (ไอโอที)อุตสาหกรรมยางพารา

    Interest

    Biophysics, Molecular Dynamic Simulations, Soft-Condense Matter, Lipid Bilayer, Lipid Peroxidation, Proteins, Polymer, Molecular Modelling, Cyclodextrin, Carbon Nanoparticle, Biological membrane, Carbon Nanotube, Fullerenes, Lipids, Natural Rubber, Monte Carlo Simulation, Computational Simulations

    Administrative Profile

    • เม.ย. 2557 - ก.ย. 2560 รองหัวหน้าภาควิชาฟิสิกส์ฝ่ายวิจัย คณะวิทยาศาสตร์

    Resource

    • จำนวนหน่วยปฏิบัติการที่เข้าร่วม 0 หน่วย
    • จำนวนเครื่องมือวิจัย 0 ชิ้น
    • สถานที่ปฏิบัติงานวิจัย
      • ห้อง - ชั้น 4 อาคารคณะสิ่งแวดล้อม
      • ห้อง 410 ชั้น 4 อาคารคณะสิ่งแวดล้อม

    งานวิจัยในรอบ 5 ปี

    Project

    งานวิจัยที่อยู่ระหว่างการดำเนินการ
    • ทุนใน 9 โครงการ (หัวหน้าโครงการ 6 โครงการ, ผู้ร่วมวิจัย 3 โครงการ)
    • ทุนนอก 0 โครงการ
    งานวิจัยที่เสร็จสิ้นแล้ว
    • ทุนใน 25 โครงการ (หัวหน้าโครงการ 17 โครงการ, ผู้ร่วมวิจัย 7 โครงการ, หัวหน้าโครงการย่อย 2 โครงการ)
    • ทุนนอก 15 โครงการ (หัวหน้าโครงการ 7 โครงการ, ผู้ร่วมวิจัย 8 โครงการ)

    แนวโน้มผลงานทั้งหมดเทียบกับแนวโน้มผลงานในรอบ 5 ปี

    Output

    • บทความ 46 เรื่อง (ตีพิมพ์ในวารสารวิชาการ 38 เรื่อง, นำเสนอในการประชุม/สัมมนา 8 เรื่อง)
    • ทรัพย์สินทางปัญญา 3 เรื่อง (ลิขสิทธิ์ 0 เรื่อง, เครื่องหมายการค้า 0 เรื่อง, อนุสิทธิบัตร 3 เรื่อง, สิทธิบัตร 0 เรื่อง)
    • สิ่งประดิษฐ์ 0 เรื่อง (ขึ้นทะเบียนพันธุ์พืช หรือพันธุ์สัตว์ หรือสิ่งประดิษฐ์ มก. 0 เรื่อง)
    • Unknown 4 เรื่อง (Unknown 4 เรื่อง)

    แนวโน้มการนำผลงานไปใช้ประโยชน์ในด้านต่างๆ

    Outcome

    • การนำผลงานไปใช้ประโยชน์ 2 เรื่อง (เชิงวิชาการ 2 เรื่อง, เชิงนโยบาย/บริหาร 0 เรื่อง, เชิงสาธารณะ 0 เรื่อง, เชิงพาณิชย์ 0 เรื่อง)

    รางวัลที่ได้รับ

    Award

    • รางวัลที่ได้รับ 1 เรื่อง (ประกาศเกียรติคุณ/รางวัลนักวิจัย 1 เรื่อง, รางวัลผลงานวิจัย/สิ่งประดิษฐ์ 0 เรื่อง, รางวัลผลงานนำเสนอในการประชุมวิชาการ 0 เรื่อง)


    Scopus h-index

    #Document titleAuthorsYearSourceCited by
    1Effect of lipid peroxidation on the properties of lipid bilayers: A molecular dynamics studyWong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J., Xu Z., Xu Z., Triampo W., Tang I.M., Tang I.M., Tieleman D.P., Monticelli L.2007Biophysical Journal
    93(12),pp. 4225-4236
    519
    2Computer simulation study of fullerene translocation through lipid membranesWong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J., Baoukina S., Triampo W., Tang I., Tieleman D., Monticelli L., Monticelli L.2008Nature Nanotechnology
    3(6),pp. 363-368
    459
    3The hydrophobic effect and its role in cold denaturationDias C.L., Ala-Nissila T., Ala-Nissila T., Wong-ekkabut J., Vattulainen I., Vattulainen I., Vattulainen I., Grant M., Karttunen M.2010Cryobiology
    60(1),pp. 91-99
    172
    4The good, the bad and the user in soft matter simulationsWong-ekkabut J., Karttunen M.2016Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes
    1858(10),pp. 2529-2538
    99
    5Bilayer Deformation, Pores, and Micellation Induced by Oxidized LipidsBoonnoy P., Jarerattanachat V., Jarerattanachat V., Karttunen M., Wong-Ekkabut J.2015Journal of Physical Chemistry Letters
    6(24),pp. 4884-4888
    97
    6Static charges cannot drive a continuous flow of water molecules through a carbon nanotubeWong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J., Miettinen M., Dias C., Karttunen M.2010Nature Nanotechnology
    5(8),pp. 555-557
    73
    7Molecular Dynamics Simulations of the Interaction of Beta Cyclodextrin with a Lipid BilayerKhuntawee W., Wolschann P., Rungrotmongkol T., Wong-Ekkabut J., Hannongbua S.2015Journal of Chemical Information and Modeling
    55(9),pp. 1894-1902
    62
    8Assessment of common simulation protocols for simulations of nanopores, membrane proteins, and channelsWong-Ekkabut J., Karttunen M.2012Journal of Chemical Theory and Computation
    8(8),pp. 2905-2911
    56
    9Lipid monolayer disruption caused by aggregated carbon nanoparticlesNisoh N., Karttunen M., Monticelli L., Monticelli L., Wong-Ekkabut J.2015RSC Advances
    5(15),pp. 11676-11685
    48
    10Molecular dynamics study of oxidized lipid bilayers in NaCl solutionJarerattanachat V., Karttunen M., Wong-Ekkabut J.2013Journal of Physical Chemistry B
    117(28),pp. 8490-8501
    45
    11Microsecond Molecular Dynamics Simulations of Intrinsically Disordered Proteins Involved in the Oxidative Stress ResponseCino E., Wong-ekkabut J., Wong-ekkabut J., Karttunen M., Karttunen M., Choy W.2011PLoS ONE
    6(11)
    42
    12A molecular dynamics study of conformations of beta-cyclodextrin and its eight derivatives in four different solventsKhuntawee W., Khuntawee W., Karttunen M., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2017Physical Chemistry Chemical Physics
    19(35),pp. 24219-24229
    35
    13Alternative metabolic routes in channeling xylose to cordycepin production of Cordyceps militaris identified by comparative transcriptome analysisWongsa B., Raethong N., Chumnanpuen P., Wong-ekkabut J., Laoteng K., Vongsangnak W.2020Genomics
    112(1),pp. 629-636
    35
    14Alpha-tocopherol inhibits pore formation in oxidized bilayersBoonnoy P., Karttunen M., Karttunen M., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2017Physical Chemistry Chemical Physics
    19(8),pp. 5699-5704
    31
    15Molecular dynamic studies of transportan interacting with a DPPC lipid bilayerPourmousa M., Wong-Ekkabut J., Patra M., Karttunen M.2013Journal of Physical Chemistry B
    117(1),pp. 230-241
    29
    16Molecular mechanism of Forkhead box M1 inhibition by thiostrepton in breast cancer cellsKongsema M., Kongsema M., Wongkhieo S., Khongkow M., Lam E., Boonnoy P., Boonnoy P., Vongsangnak W., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2019Oncology Reports
    42(3),pp. 953-962
    28
    17Does α-Tocopherol Flip-Flop Help to Protect Membranes Against Oxidation?Boonnoy P., Karttunen M., Karttunen M., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2018Journal of Physical Chemistry B
    122(45),pp. 10362-10370
    27
    18The relationship between the morphology and elasticity of natural rubber foam based on the concentration of the chemical blowing agentSuethao S., Phongphanphanee S., Wong-Ekkabut J., Smitthipong W., Smitthipong W.2021Polymers
    13(7)
    24
    19Molecular dynamics study of natural rubber-fullerene composites: Connecting microscopic properties to macroscopic behaviorKhuntawee W., Khuntawee W., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Phongphanphanee S., Phongphanphanee S., Karttunen M., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2019Physical Chemistry Chemical Physics
    21(35),pp. 19403-19413
    19
    20Molecular dynamics simulation of water permeation through the alpha-hemolysin channelWong-ekkabut J., Karttunen M., Karttunen M.2016Journal of Biological Physics
    42(1),pp. 133-146
    18
    21Dependence of fullerene aggregation on lipid saturation due to a balance between entropy and enthalpyNalakarn P., Nalakarn P., Boonnoy P., Nisoh N., Nisoh N., Karttunen M., Wong-ekkabut J., Wong-ekkabut J.2019Scientific Reports
    9(1)
    15
    22Effects of static magnetic field on growth of leptospire, Leptospira interrogans serovar canicola: Immunoreactivity and cell divisionTriampo W., Doungchawee G., Triampo D., Wong-Ekkabut J., Tang I.2004Journal of Bioscience and Bioengineering
    98(3),pp. 182-186
    13
    23In silicoandin vitrodesign of cordycepin encapsulation in liposomes for colon cancer treatmentKhuntawee W., Khuntawee W., Amornloetwattana R., Amornloetwattana R., Vongsangnak W., Namdee K., Yata T., Karttunen M., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2021RSC Advances
    11(15),pp. 8475-8484
    13
    24A stochastic model of cancer growth with immune responseBoondirek A., Lenbury Y., Wong-Ekkabut J., Triampo W., Tang I.M., Picha P.2006Journal of the Korean Physical Society
    49(4),pp. 1652-1666
    12
    25Formation of aggregates, icosahedral structures and percolation clusters of fullerenes in lipids bilayers: The key role of lipid saturationNisoh N., Nisoh N., Jarerattanachat V., Jarerattanachat V., Karttunen M., Wong-ekkabut J., Wong-ekkabut J.2020Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes
    1862(9)
    11
    26Nanocomposite of fullerenes and natural rubbers: Martini force field molecular dynamics simulationsKitjanon J., Khuntawee W., Khuntawee W., Phongphanphanee S., Phongphanphanee S., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Chattham N., Karttunen M., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2021Polymers
    13(22)
    10
    27Current challenges in thermodynamic aspects of rubber foamSuethao S., Ponloa W., Phongphanphanee S., Wong-Ekkabut J., Smitthipong W., Smitthipong W., Smitthipong W.2021Scientific Reports
    11(1)
    10
    28Fullerenes’ Interactions with Plasma Membranes: Insight from the MD SimulationsNisoh N., Nisoh N., Jarerattanachat V., Jarerattanachat V., Karttunen M., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2022Biomolecules
    12(5)
    8
    29Comparison of the effects of UV-A radiation on Leptospira interrogan serovar Bataviae, Canicola and PomonaChadsuthi S., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J., Triampo W., Triampo W., Doungchawee G., Triampo D., Triampo D.2010African Journal of Biotechnology
    9(21),pp. 3196-3206
    8
    30Role of cholesterol flip-flop in oxidized lipid bilayersBoonnoy P., Jarerattanachat V., Jarerattanachat V., Jarerattanachat V., Karttunen M., Wong-ekkabut J., Wong-ekkabut J.2021Biophysical Journal
    5
    31Explicit Calculations on Small Non-Equilibrium Driven Lattice Gas ModelsTriampo W., Tang I., Wong-Ekkabut J.2003Journal of the Korean Physical Society
    43(2),pp. 207-214
    4
    32Vacancy-mediated disordering process in binary alloys at finite temperatures: Monte Carlo simulationsWong-Ekkabut J., Triampo W., Tang I., Triampo D., Baowan D., Lenbury Y.2004Journal of the Korean Physical Society
    45(2),pp. 310-317
    4
    33Leptospirosis research: Response of pathogenic spirochete to ultaviolet-A irradiationWong-ekkabut J., Chadsuthi S., Triampo W., Triampo W., Doungchawee G., Triampo D., Krittanai C.2009African Journal of Biotechnology
    8(14),pp. 3341-3352
    4
    34Transferability of Polymer Chain Properties between Coarse-Grained and Atomistic Models of Natural Rubber Molecule Validated by Molecular Dynamics SimulationsKitjanon J., Kitjanon J., Khuntawee W., Khuntawee W., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Boonnoy P., Boonnoy P., Phongphanphanee S., Phongphanphanee S., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2017Journal of Physics: Conference Series
    901(1)
    4
    35Sequence- and Structure-Based Functional Annotation and Assessment of Metabolic Transporters in Aspergillus oryzae: A Representative Case StudyRaethong N., Wong-Ekkabut J., Laoteng K., Vongsangnak W.2016BioMed Research International
    2016
    3
    36Effect of oxidation on POPC lipid bilayers: anionic carboxyl group plays a major roleBagheri B., Boonnoy P., Wong-Ekkabut J., Karttunen M.2023Physical chemistry chemical physics : PCCP
    25(27),pp. 18310-18321
    3
    37Insight into the interactions of fullerenes with biological membranes through molecular dynamics simulationsNisoh N., Nisoh N., Jarerattanachat V., Jarerattanachat V., Dias C., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2024Advances in Physics: X
    9(1)
    2
    38Biophysical Interpretation of Evolutionary Consequences on the SARS-CoV2 Main Protease through Molecular Dynamics Simulations and Network Topology AnalysisSawang N., Phongphanphanee S., Phongphanphanee S., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T.2022Journal of Physical Chemistry B
    2
    39Atomistic molecular dynamics simulation of grapheneisoprene nanocompositesChanlert P., Wong-Ekkabut J., Liewrian W., Liewrian W., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T.2018Journal of Physics: Conference Series
    1144(1)
    2
    40Monte Carlo simulations of nanorod filler in composite polymer materialKerdkaen N., Kerdkaen N., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Phongphanphanee S., Boonchui S., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2019IOP Conference Series: Materials Science and Engineering
    526(1)
    1
    41Reply to the comment by Graziano on "The hydrophobic effect and its role in cold denaturation"Dias C.L., Ala-Nissila T., Ala-Nissila T., Wong-ekkabut J., Wong-ekkabut J., Vattulainen I., Vattulainen I., Vattulainen I., Grant M., Karttunen M.2010Cryobiology
    60(3),pp. 356-357
    1
    42A comparative study of surfactant-treated natural latex foam morphology, thermodynamic relationships and energy absorption: Talalay vs. dunlop processingTundiew N., Tundiew N., Kunklang P., Suethao S., Wong‑Ekkabut J., Mahujchariyawong J., Goh K.L., Goh K.L., Smitthipong W., Smitthipong W.2024Industrial Crops and Products
    216
    1
    43Pore Formation by Amyloid-like Peptides: Effects of the Nonpolar-Polar Sequence PatternRangubpit W., Sungted S., Wong-Ekkabut J., Distaffen H.E., Nilsson B.L., Dias C.L.2024ACS Chemical Neuroscience
    0
    44Cholesterol inhibits oxygen permeation through biological membranes: mechanism against double-bond peroxidationBoonnoy P., Janlad M., Bagheri B., Dias C., Karttunen M., Wong-Ekkabut J.2024RSC Advances
    14(40),pp. 29113-29121
    0
    45Dispersion of Hydrophilic Nanoparticles in Natural Rubber with PhospholipidsKitjanon J., Nisoh N., Nisoh N., Phongphanphanee S., Phongphanphanee S., Chattham N., Karttunen M., Wong-ekkabut J., Wong-ekkabut J.2024Polymers
    16(20)
    0
    46Self-Assembly of Aldehyde Lipids in WaterJanlad M., Janlad M., Boonnoy P., Boonnoy P., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2019IOP Conference Series: Materials Science and Engineering
    526(1)
    0
    47Monte Carlo simulations of nano-rod filler in stretched polymer nanocompositesKerdkaen N., Kerdkaen N., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Sutthibutpong T., Phongphanphanee S., Boonchuay S., Wong-Ekkabut J., Wong-Ekkabut J.2020IOP Conference Series: Materials Science and Engineering
    773(1)
    0
    48Molecular dynamics simulation of surfactant monolayersLiu B., Wong-Ekkabut J., Karttunen M., Karttunen M.2015Computational Methods for Complex Liquid-Fluid Interfaces
    ,pp. 249-264
    0